「本線側がJRから第三セクターの会社に移行したために孤立した状態になってしまったJRの路線」に乗り継ぐための特例区間は次の通りです。
いずれも「この間の駅では下車しない＝改札口から外へ出ない」という条件を守ることでこの区間の運賃は支払わずとも済む区間となります。
- 奥羽本線から八戸線へ乗り継ぐための青い森鉄道の八戸駅～青森駅間
- 奥羽本線から大湊線へ乗り継ぐための青い森鉄道の野辺地駅～青森駅間
- 八戸線から大湊線へ乗り継ぐための青い森鉄道の八戸駅～野辺地駅間
- 高山本線から氷見線及び城端線へ乗り継ぐためのあいの風とやま鉄道の富山駅～高岡駅間
- 高山本線から七尾線へ乗り継ぐためのあいの風とやま鉄道の富山駅～倶利伽羅駅間およびIRいしかわ鉄道の倶利伽羅駅～津端駅間
- 氷見線及び城端線から七尾線へ乗り継ぐためのあいの風とやま鉄道の富山駅～倶利伽羅駅間およびIRいしかわ鉄道の倶利伽羅駅～津端駅間
- 北陸本線から越美北線へ乗り継ぐためのハピラインふくいの敦賀駅～越前花堂駅間
本州から北海道に渡る・逆に北海道から本州に渡る際は「北海道新幹線オプション券」を別途購入して津軽線の津軽二股駅→北海道新幹線の奥津軽いまべつ駅～木古内駅→道南いさりび鉄道の木古内駅～五稜郭駅→函館本線へと乗り継ぐこととなります。なお道南いさりび鉄道の途中の駅では下車することが出来ません。
因みに伊勢鉄道など「JRの列車が途中で乗り入れることがある会社の路線」は当該の会社の路線にかかる運賃が別途で必要になります。例えば名古屋駅から紀勢本線の津駅以南の駅＝松阪駅・多気駅・伊勢市駅など＝まで快速「みえ」を利用する場合は伊勢鉄道の河原田駅～津駅間の運賃が別途で必要になります。
※これが嫌であれば関西本線で亀山駅まで行って亀山駅から紀勢本線に乗り継ぐという手を使えば解決します。
